Los mecanismos epigenéticos interfieren en los efectos del ambiente en el genoma, ya que controla la actividad transcripcional de genes específicos. Existen varios mecanismos que gobiernan la expresión de un gen (metilación de ADN, complejos asociados a cromatina, decodificación de ARN y modificación de histonas). En personas con enfermedades respiratorias tienen aumento de la actividad de la histona acetiltransferasa y reducida actividad de la histona deacetilasa. En infecciones la bacteria induce a desregulaciones epigenéticas afectando la estructura de la cromatina y programas transcripcionales de las células.
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